部分条款废止。第一条第（二）项和第二条废止，拜见《国家税务总局关于反常增值税扣税凭据办理等有关事项的公告》（国家税务总局公告2019年第38号）。

　　本年总局下发的《国家税务总局关于发布已失效或废止的税收规范性文件目录的告诉》（国税发〔2006〕62号）将《国家税务总局关于金税工程发现的涉嫌违规增值税专用发票处理问题的告诉》（国税函〔2001〕730号，以下简称730号文）第一条、第二条废止。各地反映730号文的有关内容废止后，对金税工程增值税征管信息体系发现的涉嫌违规增值税专用发票（以下简称发票）处理缺少根据，要求总局予以清晰。经研讨，现将金税工程增值税征管信息体系发现的涉嫌违规发票处理的有关问题从头清晰如下：

　　一、关于防伪税控认证体系发现涉嫌违规发票的处理

　　现在，防伪税控认证体系发现涉嫌违规发票分“无法认证”、“认证不符”、“密文有误”、“重复认证”、“认证时失控”、“认证后失控”和“纳税人识别号认证不符（发票所列购买方纳税人识别号与申报认证企业的纳税人识别号不符）”等类型。

　　（一）归于“无法认证”、“纳税人识别号认证不符”和“认证不符”中的“码号码认证不符（密文与明文相比较，码或号码不符）”的发票，不得作为增值税进项税额的抵扣凭据。税务机关应将发票原件交还企业，企业可要求出售方从头开具。

　　（二）归于“重复认证”、“密文有误”和“认证不符（不包括码号码认证不符）”、“认证时失控”和“认证后失控”的发票，暂不得作为增值税进项税额的抵扣凭据，税务机关拘留原件，移交稽察部分作为案源进行查办。经税务机关查看承认归于税务机关职责以及技能性过错形成的，答应作为增值税进项税额的抵扣凭据；不归于税务机关职责以及技能性过错形成的，不得作为增值税进项税额的抵扣凭据。归于税务机关职责的，由税务机关误操作的有关部分核实后，区县级税务机关出具书面证明；归于技能性过错的，由税务机关技能主管部分核实后，区县级税务机关出具书面证明。

　　二、关于增值税专用发票稽核体系发现涉嫌违规发票的处理

　　现在，增值税专用发票稽核体系发现涉嫌违规发票分“比对不符”、“缺联”和“报废”等类型。

　　凡归于上述涉嫌违规的发票，暂不得作为增值税进项税额的抵扣凭据，由办理部分依照审阅查看的有关法律法规进行核对，并按有关法律法规做处理。经税务机关查看承认归于税务机关职责以及技能性过错形成的，答应作为增值税进项税额的抵扣凭据；不归于税务机关职责以及技能性过错形成的，不得作为增值税进项税额的抵扣凭据。归于税务机关职责的，由税务机关误操作的有关部分核实后，区县级税务机关出具书面证明；归于技能性过错的，由税务机关技能主管部分核实后，区县级税务机关出具书面证明。

　　三、本告诉自2006年5月1日起履行。